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生物信息 · 2026-09-26
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编辑导读 / EDITORIAL OVERVIEW
Haplotype-specific analyses in apple: insights from 'Golden Delicious'.
本期主线来自《Haplotype-specific analyses in apple: insights from 'Golden Delicious'.》。其余来源按研究设计、量化结果、领域相关性和期刊多样性筛选。
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生物信息中文逐篇编辑
该研究发布了‘金冠’苹果的单倍型解析和定相基因组,两个单倍型大小分别为647.3 Mb和649.2 Mb,通过10,321个特异性SNP验证了定相准确性,并确认了端粒到端粒的连续性。基因预测分别鉴定出45,116和45,063个基因。利用6个单倍型解析基因组的泛基因组分析揭示了共有和特有的基因家族。该定相基因组使得全基因组等位基因特异性表达评估成为可能,以Md-PG1为例,发现单倍型2上的等位基因(GDH2-10g24673)对总基因表达贡献占主导。此外,还观察到miRNA染色体分布模式和甲基化谱的差异。这些资源为等位基因调控关键农艺性状提供了新见解,并有助于加速苹果育种。
原始研究